该学院近日宣布，研究结果将在星期五Cell期刊的封面上公布。加拿大Mount
Sinai医院的Samuel
Lunenfeld研究所的研究人员以及德国的欧洲分子生物实验室共同开发了这个被称为NetworKIN的模型，该模型精通现有研究数据，可查明控制细胞功能的蛋白质网络。
MIT生物和生物工程副教授、MIT癌症研究中心成员、论文的作者之一Michael
Yaffe在一次声明中表示，NetworKIN可使研究人员对信息进行映射。
MIT在一次声明中表示，该模型专注于被称为激酶的酶，这些酶被包含在细胞信令途径中，包括DNA修补。激酶给蛋白质增加了磷酸盐组以用于指令。Yaffe表示，细胞中30%～50%的蛋白质在任何给定时间都在进行磷酸化作用。质谱可使科学家找出发生磷酸化作用的位置，但是科学家缺乏找出哪些激酶在每个位置起作用的方法，Yaffe表示。
“这是一个大瓶颈，” Yaffe表示，他还与MIT和哈佛的Broad
Institute研究所以及贝斯以色列女执事医疗中心(Beth Israel Deaconess
Medical
Center)有关联。“我们已经发现了几千个磷酸化作用的位置，但是我们无法知道哪些激酶在进行磷酸化作用，因此我们无法知道提取它们的途径。”
研究人员过去采用两个现有的计算机程序来分析磷酸化作用点的氨基酸序列，并预测哪一组激酶最有可能与其结合并引发磷酸化作用。后来他们开发了一个计算模型来分析有关信令途径和蛋白质交互作用的信息数据库。这个程序还挖掘了已经发布的论文的原文，并对报告的蛋白质与激酶之间的交互作用进行了提炼。
通过结合这两个信息来源，这个计算模型能够开发出通过手动检查可用数据极难建立的详细网络，MIT的研究人员介绍道。“这个序列把我们带入了研究领域，但正是这种上下文信息帮助我们找出哪些激酶在哪些位置起作用，”
Yaffe表示。
CCR和Mount Sinai联合任命的博士后Rune
Linding表示，网络范围的视界允许科学家更加容易地命中多个异常基因。“将来，复杂的人类疾病将通过命中多个基因来进行治疗，”他在一次声明中表示。
为该项目提供资金的有欧盟委员会FP6计划、丹麦自然科学研究委员会、Lundbeck基金、Genome
Canada(加拿大基因组)以及美国国立卫生研究院。论文的其他作者全部来自MIT，包括生物工程博士后Gerald
Ostheimer、癌症研究中心博士后Marcel van
Vugt，以及环境卫生科学中心总裁兼生物和生物工程教授Leona
Samson。
